El Consejo de Dirección es el órgano colegiado de gobierno del Servicio de Salud, cuya composición y estructura se determinan mediante la Ley 5/2003, de 4 de abril, y los Estatutos del Servicio de Salud, de acuerdo con la Ley 7/2010, de 21 de julio, del sector público instrumental de la Comunidad Autónoma de las Islas Baleares.
Los órganos superiores de dirección del Servicio de Salud son el Consejo de Dirección, la Dirección General y la Secretaría General.
La Presidencia la ejerce la persona titular de la consejería competente en materia de salud.
Presidenta: Manuela García Romero
- director general del Servicio de Salud: Javier Ureña Morales
- director de Gestión y Presupuestos del Servicio de Salud: Yago Gómez Pérez
- gerente del Hospital Universitario Son Espases: Cristina Granados Ulecia
- gerente del Hospital Universitario Son Llàtzer: Soledad Gallardo Bonet
- gerente del Hospital Comarcal de Inca: Francisco Ferrer Sancho
- gerente del Hospital Comarcal de Manacor: Ignacio Casas Ollé
- gerente del Servicio de Atención Médica Urgente 061: Eloy Villalba Ballesteros
- gerente de Atención Primaria: Carlos Raduán de Páramo
- gerente del Área de Salud de Menorca: Bernardo M. Pax Bosch
- gerente del Área de Salud de Ibiza y Formentera: José Enrique Garcerán Azorín-Gómez
- director general de Presupuestos de la Consejería de Hacienda y Relaciones Exteriores: Bartomeu Alcover Bisbal
- director de Asistencia Sanitaria del Servicio de Salud: Raúl Lara Hernández
- secretaria general de la Consejería de Hacienda y Relaciones Exteriores: Catalina Mir Ferrer
- directora de Área de Coordinación Administrativa del Servicio de Salud: Catalina Maria Reynés Llobera
- subdirector de Presupuestos y Control del Gasto del Servicio de Salud: Andreu Díaz Rubio